EC-CUBE3用に作成した任意のプラグインのエンティティをコマンドで自動生成する方法です。
ymlファイルにテーブル定義後、以下のコマンドを実行して下さい。
vendor/bin/doctrine orm:generate:entities --extend="Eccube\\Entity\\AbstractEntity" --filter="Plugin\\[PluginName]\\Entity\\[EntityName]” app/
[PluginName]と[EntityName]は適宜変更して下さい。